很多蛀虫能破坏风干的木材，含木质成分的集装箱在进入澳大利亚时必须确保没有蛀虫感染。
集装箱中外露的木材成分必须按检验检疫要求进行永久性处理，并且进行注册以尽量减少在澳大利亚的检疫障碍。木质集装箱必须用溴甲烷或者硫酰氟进行熏蒸后在21天之内封运。每次进入到澳大利亚时都需重新熏蒸。CNI可以在我们的仓库中进行检疫要求测试。
对于没有外露木材的集装箱没有具体的检疫要求，只要集装箱不是从土壤，植物材料或感染的动物制品为原材料。
木质包装材料应该用防腐剂进行永久处理或用杀虫剂暂时处理。如果集装箱外部有秸秆、稻壳或类似植物材料应将外包装拆除并销毁外包装材料。如果不使用这些材料，检疫问题也将减少。可接受的包装替代品有金属框架，碎纸，纤维板，合成泡沫和塑料及类似材料。